Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1AQ15573 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1AQ15573 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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