Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R7Q15435 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R7Q15435 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms