Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERPUD1Q15011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERPUD1Q15011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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