Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMCO1Q147U7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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