Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAPQ14761 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAPQ14761 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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