Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1BQ14684 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1BQ14684 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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