Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBR1Q14596 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NBR1Q14596 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms