Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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