Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBM39Q14498 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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