Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBI3Q14213 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBI3Q14213 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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