Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBE4AQ14139 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
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