Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL9A3Q14050 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL9A3Q14050 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A3Q14050 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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