Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPSQ13938 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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