Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX39BQ13838 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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