Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR3Q13615 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR3Q13615 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR3Q13615 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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