Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRR1Q13601 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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