Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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