Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCIRG1Q13488 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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