Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTA1Q13424 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTA1Q13424 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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