Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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