Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP140Q13342 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP140Q13342 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP140Q13342 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP140Q13342 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SP140Q13342 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SP140Q13342 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP140Q13342 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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