Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ERCC8Q13216 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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