Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-9■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 RAB2A-203ENST00000429861 594 ntTSL 24.31□□□□□ -1.724e-9■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 JAK2-202ENST00000476574 327 ntTSL 311.68□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.048e-11■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 210.49□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 30.4
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TARDBPQ13148 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 414.89□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 30.2
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TARDBPQ13148 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 30.2
TARDBPQ13148 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 30.2
TARDBPQ13148 ENTPD1-AS1-208ENST00000451364 716 ntTSL 25.83□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 30.2
TARDBPQ13148 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 30.2
TARDBPQ13148 HSDL1-208ENST00000619773 3059 nt8.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 30.2
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TARDBPQ13148 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 30.2
TARDBPQ13148 CDK12-205ENST00000559663 871 ntTSL 58.48□□□□□ -1.055e-8■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 30.1
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TARDBPQ13148 ZNF274-213ENST00000619307 1566 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.416e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.296e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-206ENST00000595146 4852 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.316e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ZNF274-211ENST00000615675 1259 ntTSL 211.46□□□□□ -0.576e-9■■■■■ 30.1
TARDBPQ13148 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 30.1
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