Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM32Q13049 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM32Q13049 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM32Q13049 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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