Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCB1Q12824 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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