Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
HMGXB3Q12766 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
HMGXB3Q12766 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
HMGXB3Q12766 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
HMGXB3Q12766 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
HMGXB3Q12766 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
HMGXB3Q12766 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
HMGXB3Q12766 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms