Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 LAS1YKR063C 1509 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SVF1YDR346C 1446 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 FMP30YPL103C 1407 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 EGT2YNL327W 3126 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 DXO1YDR370C 1329 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 COS4YFL062W 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SRB5YGR104C 924 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SOL4YGR248W 768 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 WSS1YHR134W 810 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SEC72YLR292C 582 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 RPP0YLR340W 939 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 COS3YML132W 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 PHA2YNL316C 1005 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YDC1YPL087W 954 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YPL278CYPL278C 303 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 COS2YBR302C 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 ARH1YDR376W 1482 nt4.05□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 GSY1YFR015C 2127 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 PHM7YOL084W 2976 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YML020WYML020W 1995 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 TAF12YDR145W 1620 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 TRF5YNL299W 1929 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 LPP1YDR503C 825 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 FRA2YGL220W 363 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YIL163CYIL163C 354 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 ACP1YKL192C 378 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SUI1YNL244C 327 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YPR071WYPR071W 636 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 GCR1YPL075W 2358 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 DPH6YLR143W 2058 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 PUT2YHR037W 1728 nt4.04□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 APC1YNL172W 5247 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YDL183CYDL183C 963 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 RPL24AYGL031C 468 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 SAE3YHR079C-A 276 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 CSM2YIL132C 642 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 FMP46YKR049C 402 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 YMR315WYMR315W 1050 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 PTA1YAL043C 2358 nt4.03□□□□□ -1.76
SNF8Q12483 BUD8YLR353W 1812 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YER085CYER085C 522 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YAR023CYAR023C 540 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 MAP1YLR244C 1164 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RRP40YOL142W 723 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 ALG5YPL227C 1005 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 NAT3YPR131C 588 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 THS1YIL078W 2205 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 MST1YKL194C 1389 nt4.02□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 MNN4YKL201C 3537 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 FDC1YDR539W 1512 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 GIP4YAL031C 2283 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 MDL1YLR188W 2088 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 CNB1YKL190W 528 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 VPS68YOL129W 555 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YOR289WYOR289W 756 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YOR379CYOR379C 339 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YPR174CYPR174C 666 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 OCT1YKL134C 2319 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 BDP1YNL039W 1785 nt4.01□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 HST1YOL068C 1512 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YDR132CYDR132C 1488 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RPC53YDL150W 1269 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 MRPL25YGR076C 474 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 SPC42YKL042W 1092 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YPL014WYPL014W 1146 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YBR219CYBR219C 384 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 SUL2YLR092W 2682 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 CDC6YJL194W 1542 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RRN11YML043C 1524 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 GLN4YOR168W 2430 nt4□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 VPS73YGL104C 1461 nt3.99□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YPK9YOR291W 4419 nt3.99□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 CDC9YDL164C 2268 nt3.99□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 DAS2YDR020C 699 nt3.99□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YLR152CYLR152C 1731 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 OPT2YPR194C 2634 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RPL14AYKL006W 417 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 NMD4YLR363C 657 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 HEK2YBL032W 1146 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 TOM7YNL070W 183 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 AST1YBL069W 1290 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 VPS69YPR087W 321 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 EFM2YBR271W 1260 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 AZR1YGR224W 1842 nt3.98□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RGP1YDR137W 1992 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 PTC1YDL006W 846 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 RPP1AYDL081C 321 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 AAD6YFL056C 639 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 EFB1YAL003W 621 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 YBL029WYBL029W 1131 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 NUG1YER006W 1563 nt3.97□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 TFA1YKL028W 1449 nt3.96□□□□□ -1.77
SNF8Q12483 SAT4YCR008W 1812 nt3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms