Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CGNL1Q0VF96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNL1Q0VF96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms