Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD3Q0VAK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms