Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms