Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM2AQ08AH3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM2AQ08AH3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms