Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms