Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLEQ07864 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLEQ07864 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms