Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL18Q07020 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms