Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK18Q07002 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms