Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms