Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG1Q06432 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms