Protein–RNA interactions for Protein: Q05DH4

FAM160A1, Protein FAM160A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM160A1Q05DH4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM160A1Q05DH4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM160A1Q05DH4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms