Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD164Q04900 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD164Q04900 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD164Q04900 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD164Q04900 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms