Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TLE4Q04727 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TLE4Q04727 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms