Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBE1Q04446 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms