Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV1Q03135 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV1Q03135 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms