Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4A11Q02928 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4A11Q02928 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4A11Q02928 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms