Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP4Q01664 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFAP4Q01664 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms