Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA6Q01524 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms