Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F8P98187 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F8P98187 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms