Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA4P83105 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms