Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX1P78414 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRX1P78414 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRX1P78414 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRX1P78414 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRX1P78414 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRX1P78414 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRX1P78414 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms