Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAE1P78406 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAE1P78406 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAE1P78406 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAE1P78406 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAE1P78406 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAE1P78406 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAE1P78406 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms