Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms