Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL11P62913 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL11P62913 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL11P62913 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL11P62913 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms